其實一切都是意外。
這個本來是測試不同染色方法被污染的程度、以及牛奶agar滅菌程度。(註:由於牛奶在正常的122 °C 加熱20分鐘會變性,查到Sigma Aldrich網站上說他們的skimmed-milk powder只能加熱5分鐘,因此測試。)當時做法為將滅菌過的牛奶agar倒進去後,再滴入紅E122與藍E133兩種顏料,並輕微旋轉搖晃蓋著的培養基讓顏色逐漸混合,但卻未完全混合,以製造顏色漸層。放置五天後表面開始出現白色的菌落、並且有部分培養基牛奶被消化而變成透明。手上因為剛好有養著玩的黏菌Physarum polycephalum (黃色的那些),所以就把牠們放上去,看看會不會有互動出現。在培養兩天之後剛好之前的縮時攝影相機空下來,便順手拍了縮時。另一個用意是想要測試我的縮時攝影棚到底有沒有污染… (結果有!要改設計了!) Read More
今天將NeuroSky Mindwave Mobile的訊號接上Processing了,使用的是Andreas Borg的ThinkGear Java Socket (Github)。NeuroSky有出一個叫做ThinkGear的SDK。在Processing端有Jorge C. S. Cardoso 寫的Mindset Processing Library從Serial port讀取訊號,以及我使用的ThinkGear Java Socket,從127.0.0.1的port 13854讀取JSON訊號。
根據NeuroSky的ThinkGear SDK技術文件,ThinkGear分成ThinkGear Connector (連接Mindwave Mobile以及其他腦電波裝置)、以及ThinkGear Communication Driver(提供API連接電腦與ThinkGear Connector連接到的裝置)。因為ThinkGear只提供Mac與PC的API,其他平台則可以使用Serial Stream來讀取訊號(這大概也是為什麼Cardoso的library是讀取serial port吧!) Read More
這已經是大概第十幾次我嘗試縮時攝影。每次嘗試都會遇到水汽凝結的問題,讓燈光照一照後溫度微微升高,Agar裡的水汽就會凝結在培養皿蓋子上,阻礙視線。在嘗試過將蓋子擦乾、不封口、蓋子上方加塑膠版、agar製備後放兩天再使用、噴潛水防霧噴霧,種種嘗試之後,總算到了一個可以維持多天方式:
用盒子把培養皿罩起來。 Read More
在技術人員David與Luis的幫助之下,我的印表機已經架好,只剩噴頭。 今天開始測試用Raspberry Pi接上Perusa i3遠端列印。 此外David為了我的Project寫了一個可以從Processing產生gcode直接餵給印表機的軟體: 接下來就是如何把腦波數據放進Processing裡面改變線段的穩定度這部分了! Read More
上上週因為買到的食品級Agar煮出來顏色不夠好看透明,一怒之下多方尋找西班牙當地的Agar供應商。誰知,找到一間位於Gijon與Oviedo之間的專業實驗用Agar製造商Roko Agar。以一個死馬當活馬醫的心情寄信問他們是否有賣小量(約100g)的Agar,並簡短介紹這個計劃以後,隔天竟然收到了他們的電話! 電話接起來第一句話是中文的「你好!」當我正疑惑著怎麼西班牙號碼又講中文時,對方表示他是Roko Agar的董事總經理Pedro,很驚訝在他住的城市Gijon竟然有來自台灣的藝術家需要拿他們的產品養細菌。由於他們只賣大量的、但覺得我的計劃太有趣了,決定贊助我免費agar! 上星期五,Pedro帶著agar來LABoral拜訪。我這才知道Roko Agar從1955年開始在Austurias區域製造agar,從Gijon附近的海岸採收紅藻進工廠內蒸煮、漂白。但西班牙沿岸的紅藻在冬天天氣太冷、並且當地沒有養殖紅藻的技術,他們現在與中國福建、廣東沿岸的紅藻養殖合作,採收乾燥後送至西班牙、距離我駐村地方30分鐘車程的工廠內加工。工廠每週七天24小時輪班不停機,是世界上最大的agar製造商之一。而Pedro本人時常前往福建廣東沿海,並多次到過廈門,對於台灣非常有興趣。他也談到其實每一批agar的顏色,如果沒有漂白的話,是會有不同深淺的。而為了要讓實驗室裡的人感覺安心,才特別加上不必要的漂白手續。這也是為什麼我拿到食品級的agar顏色比較深的原因。 可惜現在正在等著培養皿到來,不然我等不及要試新的agar了! Read More
這張圖是養了第二天(48 hrs)之後的某種土壤細菌。根據陳俊堯教授跟Simon Park教授都認為應該是Bacillus家族,但是詳細品種不明。也許是Bacillus subtilis, 也許是 Bacillus mycoides. 三天後: 同一盤菌四天以後的樣貌: 而在40倍電子零件用光學顯微鏡底下長這個樣子: 其實當初同一批有其他顏色,但不知道是不是我一開始接種的時候沒接種好,都沒東西長出來。也許是當時很土砲的使用銅線來接種所致。所以在9/25號又重新接種了紅、黃、藍三個純色。 黃色培養基 (24hrs) (48 hrs) 藍色培養基 (24 hrs) (48 hrs) 紅色培養基 (24 hrs) (48 hrs) 以及牛奶紅色培養基: (24 hrs) (48 hrs) 後面兩張是牛奶培養基培養兩天以後,可以看到這種菌會把色素跟牛奶分解掉,變成透明的。 而原本這盤的側邊也可以看到紅色素被消化掉的痕跡: 這種菌與它所在的營養環境的互動還蠻有意思的,可以感受到環境因它的存在而有所改變了。也許可以成為之後曼陀羅設計的一個元素?關於這個部分Fenix提供了一個參考資料:A simple method to screen for azo-dye-degrading bacteria. 另外根據Simon Park教授的建議,他曾發現Bacillus mycoides會受培養基張力影響而改變生長形態(參考連結:Variation in the Morphology of Bacillus mycoides Due Read More
不知為何,買到的食品級agar透明度低,加了yeast extract之後就又更濁了,菌在上面幾乎看不見。在與陳俊堯老師討論以後,決定使用食用色素測試。在家樂福找到紅(E122)、黃(E102)、藍(E133)三色。而在顏色上,也嘗試使用低脂奶粉替代yeast extract作為碳源,使用製冰盒測試顏色效果與生長狀態。 此為牛奶培養基基底,未滅菌,一天後的生長狀態。 此為酵母培養基基底,未滅菌,一天後的生長狀態。注意紅色區域開始出現會消化紅色色素的菌。 又過了兩天以後: 如同小宇宙的牛奶培養基! 我特別愛右上角紫色的那格,幾乎有種金箔的感覺…. 以及酵母培養基的陳舊文青風格褪色… 似乎這個菌不只會分解紅色,也會分解黃色。但是分解黃色的速度要比紅色來的慢?或是有黃色的那幾格不見得有同樣的菌種存在? 這次測試有趣的地方在於,培養基完全沒有特別接種,就是放在空氣中等它們被「污染」。之前Oron Catts曾說培養基就是微生物sensor。其實也就如一面面鏡子映射著我們平常不會有感知的世界。 那這樣是不是也會擴展我們對一個地點的了解呢? Read More
2015年9月18日,趁著同樣在LABoral駐村的藝術家Coco與Ivan的工作坊,到Gijon臨近的山上一趟。也趁機帶著身上唯一一個培養皿與第一次測試的yeast extract培養基前往採樣。 三天後得到這樣的結果: 裡面疑似出現我一直想要找的Bacillus家族細菌,於是立刻燒水備培養皿,把它獨立培養出來(上面還有不小心把培養基戳破的痕跡…. >”<): Read More
這次要在不熟悉的國家快速弄起一個簡單的BioLab,卡是不停地刷。主要是Gijon並不是太大的城市,僅有二十幾萬人口,想當然奇怪的東西也不多。 目前觀察到幾個方便的購買方式: 設備類: Amazon.es 儀器類: eBay.co.uk 材料類:西班牙出乎意料的,Agar(洋菜膠)特別好買,幾乎大的超市、有機養生店(herbolarias)都有。而常用的酵母萃取物 — 英國人最愛Marmite卻是出乎意料的難找,反而有很多levadura(酵母粉),而且處處都有。賣給我的herbolarias老闆還說,很好吃,可以加yogert或加水。 酒精只買得到96%並摻了Chlorobenzene的酒精。 蠟燭很多。 內衣店很多。 藥局更多,幾乎每五步路一間、還有很多24小時藥局。 玻璃瓶意外難找。 在西班牙訂東西,當天中午訂隔天早上就會到!效率堪稱驚人。 就算我不會說西班牙文、他們不會說英文,店員還是會很認真的用西班牙文把東西解釋完,友善度100分。 目前「廚房實驗室」大致準備周全,設備清單如下: 從Fablab借來的秤 壓力鍋 火力不足的爐子 量杯 園藝噴瓶,小花造型。這是找到按壓式噴頭最便宜的選項… 酒精 1L 變性酒精 1L 紙巾 棉花棒 鹽巴 洋菜膠 Agar Agar – 我對這個洋菜膠超失望的,顏色很深,配起來很混濁 🙁 可能需要重買 酵母粉 前人留下來的筷子作為攪拌棒 Autoclave indication tape Parafilm Eppendorf 玻璃瓶數個,有些是從儲藏室挖出來的 台灣帶來的15cm玻璃培養皿一個 😀 試過用壓力鍋與烤箱滅菌,不小心烤融了棉花棒… 因為棒子是塑膠做的。其餘一切都好。 這幾年這樣亂搞,用烤箱烤Premo (Supersculpy)、烤棉花棒、用slow cooker炖polymorph… 大概有天會死於化學毒物累積… Read More
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